入定說咒
時彼世尊，入三摩地，名曰除滅一切眾生苦惱；
既入定已，於肉髻中出大光明，光中演說大陀羅尼曰：
上面說藥師如來由大悲願力，
觀察眾生的病苦；
既然深知眾生病情，
為滿足眾生的願求，特為施設方便，
入定宣說神咒。
那「時」候，「彼」藥師「世尊入三摩地」──定。
三摩地，此譯等持，即平等持心，
不惛沈，不掉舉，令心保持平衡、安靜，
而專注於一境。

在經中，佛將說法、說咒，或現神通時，
每每先入定。
佛原無時不在定境中，
無論穿衣、吃飯、說法度生，
佛的心境都常安住定中。
  
不過為與眾生作示範，適應眾生的心情，
故每欲說法（咒）現通的時候，即首先入定。
佛法雖不特別重視定，
但一切功德智慧，確都由定中流出。
定的種類很多，根據其不同作用，而安立種種名稱；
現在藥師如來所入的三摩地，
叫做「除滅一切眾生苦惱」定。
藥師如來「入定」後，
即「於肉髻中出大光明」。
頭頂上的肉髻，
為佛的三十二相之一，名無見頂相。
頭部為全身最高最貴的所在，
今從佛的無見頂上放大光明，
這即表示從最高定發究竟慧；
身光先發，心光也就隨應而來。
慧發於定，而說法說咒，
則又是從智慧流出的善巧方便，
故從無見頂上放大光明。
  
大乘經所說咒語，
每有從佛的無見頂放光說出，
如楞嚴咒，即是佛頂放光化佛而宣說出來的。
頂髻在佛的最高處，我們所不能見，

表示此咒從佛最高的智慧中流出，深妙不可思議。
「光中演說大陀羅尼」：陀羅尼，譯為總持，
其中含二義：一持，二遮；
能攝持一切功德，遮障一切罪惡；
也即是總一切法，持無量義。
在佛經中 ，有文字陀羅尼、語言陀羅尼等多種，
此處是咒陀羅尼，因其功用大，故名大陀羅尼。
　　
南謨薄伽伐帝，鞞殺社窶嚕，薜琉璃，
缽喇婆，喝囉闍也，
怛陀揭多耶，阿囉喝帝，三藐三勃陀耶。
怛姪他：
唵！鞞殺逝，鞞殺逝，鞞殺社，三沒揭帝，娑訶！
向來以為咒是秘密藏，持念就好，不可求解；
其實咒語大部份都可以解釋，
祗有極少幾句在可解與不可解之間。
「南謨」，     即皈依、皈命的意思。
「薄伽伐帝」， 為薄伽梵的異譯，也即是世尊。
「鞞殺社 窶嚕」，是藥師。
「薜琉璃」，    即是琉璃。
「缽喇婆」，    是光。

「喝囉闍也」，  是王。
「怛陀揭多耶」；是如來。
「阿囉喝帝」，  是應（供）。
「三藐三勃陀耶」，是等正覺。
這幾句綜合起來，
即是：『皈命世尊藥師琉璃光王如來、應、等正覺』。
  
以下才是真正咒心：
「怛姪他」，就是『即說咒曰』的意思。
「唵」，應讀作嗡音，意義很多。
     1.皈依義，即是集中身心而向於三寶；
     2.警覺義，提起注意，
              也就是把精神集中起來，
              注意一個地方。
  
「鞞殺逝，鞞殺逝，鞞殺社」，
  即是說：藥！藥！藥！
  
「三沒揭帝」， 即是普度，
              普遍救度一切眾生之義。
  
「娑訶」，也作『娑婆訶』，  意思是速得成就，
         等於中國古代文書中的『急急如律令』。
此咒
上半是皈依藥師如來，祈求加被；
下半是說用藥治療一切眾生病苦，
      希望立即痊癒。
佛教中的咒語，形式大多如此，
一開頭
就是歸依什麼佛或什麼菩薩，
如大悲咒的
「南無喝囉怛那哆囉夜耶』等，
即是歸依三寶，
歸依聖觀音菩薩的意思，
  
往生咒的
『南無阿彌多婆夜』，即是歸依阿彌陀佛；
還有善天女咒，
以及其他許多咒語，
也都以歸依為開始。